有關台灣水資源保育聯盟提出環保署公有掩埋場地下水監測資料，提及城西掩埋場地下水監測氨氮項目超出監測基準，臺南市環保局說明如下:
臺南市城西掩埋場已設置污水處理廠處理滲出水至符合放流水標準後排放，另為掌握掩埋場鄰近區域地下水質狀況，環保局亦每季進行採樣檢測，持續掌握地下水質變化情形。
104年度至108年度採樣結果，氨氮檢測項目雖然超出地下水監測基準，整體數據變化趨勢大致穩定，由於城西掩埋場鄰近海邊，地下水位及水質變化易受海水潮汐影響。同時，臺灣地區淺層土壤含豐富有機物質，經由生物分解作用成厭氧狀態，氨氮為氮循環的中間產物，因厭氧無法轉換成硝酸鹽，因此會造成地下水的氨氮測值偏高現象。由於地下水中氨氮來源較為複雜，目前「地下水污染管制標準」雖未將氨氮列入管制項目，本局仍將持續監控掌握。
城西掩埋場周遭並無斷層地帶，亦非屬飲用水水源，環保局除持續辦理監測工作外，亦妥善操作滲出水處理廠、每日進行掩埋場巡查工作及進行擋土牆維護管理，後續亦將蒐集濱海地區地下水監測資料進行比對，以掌握監測數據變化情形。