明祥馨公司104年間經臺南市政府環保局發現收受之爐碴未依經濟部公告之「經濟部事業廢棄物再利用管理辦法」規定使用，非法填埋於學甲區大灣段農地，環保局於104年9月21日採最嚴格的裁處，斷然廢止其再利用機構身分，並限期改善且於隔年即挖除5萬5千餘噸完成改善。
108年發現明祥馨公司亦在學甲區大灣段其他農地非法填埋爐碴，環保局於109年主動檢具案卷函送臺南地檢署並全力配合調查。
109年學甲爐碴案農地預估清理數量達3.3萬公噸，環保局要求業者必須在180工作天內清運完畢，業者挖除期間環保局每日派員現場監督管控清運並直播，全程公開接受全民監督，共挖出4萬3千餘噸，成為全國第一個完成非法堆置爐碴場址清除之縣市，另在工業用地部分，對於不符合使用規定之爐渣，亦要求清理，目前已累積清除約6萬7千8百噸，仍持續依規定清理中。
109年迄今，環保局共進行6次地下水質採樣監測，8項重金屬皆低於地下水污染監測標準，未來將持續於枯、豐水期監測，追蹤地下水品質。目前為止，環保局在該地周遭所做的地下水及土壤採樣檢測均未超出管制標準。
環保局秉持一貫維護環境立場，不論是賴清德市長主政或是黃偉哲市長主政，都以勿枉勿縱的態度，主動稽查執行公權力，對違規情事均依環保署訂定之裁罰準則計算罰鍰額度予以處分並要求改善，甚至於或祭出最嚴厲處分，廢止其再利用身分，戮力降低危害環境情事發生。