109年度歲出預算編列1,005.76億元，較108年度預算862.59億元，增加143.17億元，主要係因中央計畫型補助含市配合款增加105億元，另積極推動各項重大建設，如圖書館總館新建工程、赤崁文化園區改造工程、岸內糖廠影視基地發展計畫等，再者因應中央人力政策增加警消人事費、提高清潔隊員獎金致須增撥勞工退休準備金差額及配合辦理中央少子女化對策計畫等增加36億元預算，導致預算總額增加。
109年度歲入核列946.8億元，較108年度預算862.59億元，增加84.21億元，主要係本市自109年起順意民意實施房屋稅輕稅政策，預估房屋稅將減少23億元，但考量新建房屋自然成長等因素，經重新核算後較108年減少約18.89億元，另其他地方稅課增加5.25億元、統籌分配稅增加15.41億元、遺贈稅增加0.94億元、菸酒稅減少0.64億元，整體稅課收入仍較108年增加2.07億元、財產收入增加3.18億元、補助收入增加101.65億元、其他自籌財源增加2.34億元及營業盈餘及事業收入減少25.03億元。
因各項歲出都是依法、配合中央政策或推動重大建設所需，因此109年歲入出差短58.95億元不得不以同額舉債方式彌平。另109年因受新冠肺炎疫情影響，市府為協助市民渡過疫情而提出多項紓困與振興措施，造成歲入短收與歲出增加，但在市府團隊努力下，截至8月底止，尚無需新增舉借公共債務來因應資金缺口。未來年度預算編列市府仍會堅守財政紀律，務求運用有限的財源讓每分錢都花在刀口上，後續亦將持續推動各項開源節流，隨時注意歲入歲出預算執行情形，審慎評估舉債之必要性，以落實市長恪守財政紀律之承諾。