台南轉運站以獨特的貨櫃組合風格、開放式空間設計，搭建出享譽國際的代表性建築物，思維改變不再拘泥於長久以來單調的廁所設計方式，為過往的旅客增添了一絲另類經驗（驚艷），交通局也請男乘客放心使用，不會有春光外洩的窘境發生。
交通局局長王銘德指出，臺南轉運站是市長黃偉哲相當重視的交通建設，利用貨櫃堆疊創造出大量開放式的活動空間，並透過各種運具分流及妥適安排場內動線，以發揮轉運站轉乘接駁效能，與台灣各地如高雄貨櫃藝術節、屏東青創聚落i/o Studio、台東TTStyle原創館、桃園G10 GO市集、星巴克花蓮洄瀾門市、龍潭湖畔悠活園區等貨櫃組合建築物有著明顯區別。
局長王銘德表示，來台南旅遊的人大多都能感受到整體的氛圍是放鬆的、緩慢的，台南轉運站開放式的空間設計也承襲了這番思維，減少封閉式空間的壓迫感，而在衞生及清潔維護作業的考量下，台南轉運站男廁只是將原小便斗前方牆面向外推，留設出一個較開闊的空間，廁所外的人仍無法看到廁所內部，絶對不會有隱私權外露的問題。
公共運輸處處長呂獎慧補充說明，台南轉運站的廁所牆面均採用通風效果佳的復古式空心磚，無論男女廁均有相當良好的通風品質，不僅無臭、更不會悶熱！男廁牆面外推後的空間，未來也將請委外營運團隊構思美化，讓如廁的男性朋友能更加輕鬆自在。
台南轉運站現正試營運中（至109年1月5日止），為鼓勵民眾使用並熟悉轉運站各項服務，推出國道客運折價券（限台南轉運站購票）、停車場免費停車及相關店鋪優惠回饋，更同步舉辦抽獎活動，最大獎為時下流行之iphone11智慧型手機1支，歡迎市民朋友、舊雨新知共襄盛舉！